芦强 , 邵芬娟 , 邱德有^*

中国林业科学研究院林业研究所, 北京, 100091
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2018 年, 第 37 卷, 第 44 篇   
收稿日期: 2016年11月17日    接受日期: 2017年01月17日    发表日期: 2018年01月25日

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LBD (lateral organ boundaries domain)蛋白是一类植物所特有的转录因子，在调控植物生长发育、营养代谢以及逆境胁迫的响应等方面发挥重要作用。然而，在基因组水平上对毛果杨LBD基因家族的研究还未曾有过报道。本研究利用生物信息学方法，从毛果杨基因组中鉴定出57个LBD基因并预测其分子量和等电点，这些基因分布于毛果杨18条染色体和Scaffold_65、Scaffold_86上。该家族成员基因结构简单，内含子数目不超过2个。进化关系分析显示毛果杨LBD基因可分为ClassⅠ和ClassⅡ两大类，细分为Ⅰa、Ⅰb、Ⅰc、Ⅰd、Ⅰe、Ⅱa和Ⅱb等7个亚类。分析基因表达模式发现，该家族成员的表达具有一定时空特异性，并响应氮素胁迫处理。本研究为深入研究毛果杨LBD基因的功能奠定了基础。

毛果杨；LBD基因家族；系统进化分析；基因表达